Mete Yarar, Türk Silahlı Kuvvetleri'nden ayrılma kararıyla dikkatleri üzerine çekti. Emekliliğine kısa bir süre kala, askeri kariyerini sonlandırarak sivil hayata adım atmayı tercih etti. Bu geçişin arkasında yatan motivasyonlar, uluslararası güvenlik alanında daha aktif bir rol almayı arzulaması olarak öne çıkıyor.
Mete Yarar, 2004 yılında, emekliliğine 1,5 yıl kala kendi isteğiyle Türk Silahlı Kuvvetleri'nden (TSK) ayrılmıştır.
Ayrılma sebebi tam olarak açıklanmamış olsa da, sivil hayatta daha etkin çalışmak ve uluslararası güvenlik sahasında yer almak istemesi bu kararın nedenlerinden biri olarak belirtilmiştir.